과학자들은 아틀라스가 실행 진 표현
2009년 6월 25, - 안으로 배치하는 약물 연구 | 아니오 코멘트»오늘날, 유럽 분자 생물학 연구소의 유럽 생물 정보학 연구소 (EMBL - 에비에서 연구자)는 새 데이터베이스를 시작, 유전자 표현 아틀라스, 과학자들은 검색하고 전례없는 정밀도와 범위에서 유전자 표현 데이터를 비교할 수 있습니다. 새 관찰 방법 유전자 개발 아래의 표현이 다릅니다 다른 세포 유형과, 휴지 유전자 이해 질병 도움말 조건 수있는 연구자와 기능이 마약 과 치료법.
유기체 공유에 가장 세포가 동일한 유전 정보가 다른 세포 유형은, 예를 들어 피부와 간 세포에 대해, 다른 속성과 함수, 덕분 서로 다른 유전자가 활성이 세포에 있지만. 진 표현 아틀라스는 허용하는 새 데이터베이스는 서로 다른 세포 유형, 발달 단계, 생리적 상태, phenotypes과 질병 상태를 포함한 생물 학적 조건의 범위 아래의 쿼리 유전자 표현에 사용자,. 이 새로운 데이터베이스로 요약될 수있는 답변 드리겠습니다 주요 질문 :
1. 어떤 조건에서 관심을 내 특정 유전자가 표현?
2. 어떤 유전자가 특정 상태로 표현입니까? 예를 들어, 어떤 유전자는 특히 신장 세포에서 활성되거나 방법 leukemic 혈액에서 유전자의 표현을 않는이 정상 혈액에 비해 차이가 있습니까?
두 질문은 또한 특정 유전자와 특정 질병에있는 그들의 역할에 이러한 암로 표현하는 Wnt 신호 통로의 구성원을 파악으로 초점을 결합할 수 있습니다.
아틀라스는 다른 독립적인 연구를 1000여에서 데이터를 collates, 주로 microarray 실험, 총 30,000 개 이상의 샘플이 있습니다. 새 데이터베이스는 에비의 Microarray Informatics 그룹의 최신 제품이며 에비의 ArrayExpress 자원에의 기원을했다. 개발 단계 후, 아틀라스는 독립적인 주요 자원으로서의 인생을 시작할 준비가되었습니다. Misha Kapushesky는 에비에 아틀라스 프로젝트 리더, "ArrayExpress 보관 기능 유전체학 높은 처리량에서 데이터를 만드는 동안 주석의 전문가가 사용할 수 assays, 진 식 아틀라스는 어떤 형식으로 생물학에 액세스할에이 정보를 보여줍니다. 아틀라스 직접 ArrayExpress 보관, 그때 curation로 농축입니다에서 데이터를 소요, 그 결과가 사용자에게 쉽게 액세스할 수 형태로 제시되기 전에 다시 주석 및 통계 계산. "
진 표현 아틀라스는 이미 가치있는 연구 플랫폼으로 제약 업계에서 사용을 발견했다. 리소스가 http://www.ebi.ac.uk/gxa에서 Microarray Informatics 그룹에 액세스할 수있는 전자 튜토리얼 아틀라스을 최대한 활용하는 방법에 대한 사용자 가이드 배우는 생산했습니다. 본 자습서에서는 자유롭게 사용할 수 에비의 전자 포털 http://www.ebi.ac.uk/training/elearningcentral/에서 학습입니다.