Talk Droga

Xjentisti tnedija Gene Espressjoni Atlas

25 Ġun 2009 - Posted fil -Riċerka Droga | Nru »Kummenti

Illum, riċerkaturi fl-Istitut Ewropew Bijoloġija Molekulari Laboratorju tal-bijoinformatika Ewropew (EMBL-EBI) jniedu database ġdida, l-Atlas Espressjoni tal-ġeni, li jippermetti xjentisti ta 'tiftix u tqabbel l-informazzjoni l-espressjoni tal-ġeni fil-dettal bħal qatt qabel u l-ambitu. Josservaw kif espressjoni tal-ġene tvarja tipi ta 'ċelluli differenti, it-tessuti u taħt kondizzjonijiet ta' mard jistgħu jgħinu lir-riċerkaturi jifhmu funzjoni tal-ġeni u biex jiżviluppaw ġodda drogi u terapiji.

Għalkemm iċ-ċelluli l-aktar fil sehem organiżmu-istess tagħrif ġenetiku, tipi ta 'ċelluli differenti, għall-ġilda eżempju u ċelluli tal-fwied, jkollha proprjetajiet u funzjonijiet differenti, prinċipalment minħabba ġeni differenti huma attivi f'dawn iċ-ċelluli. L-Atlas Espressjoni ġeni hija database ġdida li tippermetti lill-utenti għall-espressjoni tal-ġene jsaqsu taħt firxa ta 'kondizzjonijiet bijoloġiċi, inklużi tipi differenti ta' ċelluli, stadji ta 'żvilupp, fiżjoloġiċi stati, fenotipi u stati marda. Il-mistoqsijiet ewlenin din id-database l-ġdida tista 'twieġeb jistgħu jiġu mqassra kif ġej:

1. taħt liema kondizzjonijiet hu b'ġene partikolari tiegħi ta 'interess espress?
2. li ġeni huma espressi fi stat partikolari? Per eżempju, dak li ġeni huma speċifikament attivi f'ċelluli tal-kliewi, jew kif ma l-espressjoni tal-ġeni fid-demm leukemic differenti meta mqabbla ma 'tad-demm normali?

Iż-żewġ mistoqsijiet jistgħu wkoll jiġi magħqud sabiex tiffoka fuq il-ġeni partikolari u r-rwol tagħhom ta 'mard speċifiku, bħall-identifikazzjoni membri tal-mogħdija Wnt sinjalar li huma espressi fil-kanċer.

L-Atlas tqabbel id-data minn iktar minn 1000 studji indipendenti differenti, esperimenti microarray prinċipalment, b'aktar minn 30,000 kampjuni totali. Id-database l-ġdida huwa l-prodott aħħar tal-grupp ta 'l-EBI tal-Informatika Microarray u għandu l-oriġini tagħha fil riżors ArrayExpress l-EBI's. Wara fażi ta 'żvilupp, l-Atlas hija lesta li tibda ħajja tiegħu bħala riżors ewlieni indipendenti. Misha Kapushesky, proġett Atlas mexxej fil-EBI ikkummenta, "Filwaqt li l-Arkivju ArrayExpress tagħmel data minn throughput għoli ġenomika funzjonali analiżi disponibbli għall-esperti, tal-ġeni Espressjoni Atlas jippreżenta din l-informazzjoni f'format aċċessibbli għal kwalunkwe bioloġista. L-Atlas tieħu data direttament minn l-Arkivju ArrayExpress, li mbagħad tistgħana bil curation, mill-ġdid annotazzjoni u komputazzjonijiet istatistika qabel ma r-riżultati jiġu ppreżentati lill-utent f'forma faċilment aċċessibbli. "

L-Atlas Espressjoni ġeni diġà kkonstatat użu fl-industrija farmaċewtika bħala pjattaforma ta 'riċerka ta' valur. Ir-riżorsa tista 'tkun aċċessata minn http://www.ebi.ac.uk/gxa u l-grupp Informatika Microarray ipproduċew' e-tagħlim tutorja biex jiggwidaw lill-utenti dwar kif tikseb l-aktar mill-Atlas. Dan tutorja huwa liberament disponibbli mill-EBI e-tagħlim portal fuq http://www.ebi.ac.uk/training/elearningcentral/.