Научници пуштање брода у море гена атлас
Јуни 25тх, 2009 - Постед ин Друг Ресеарцх | Ниједан Примедба »Данас, истраживачи у Европској лабораторији за молекуларну биологију европске Биоинформатика институт (ЕМБЛ-ЕБИ) покрене нову базу података, гена атлас, који омогућава научницима да тражи и упоредити податке гена у преседана детаље и обим. Посматрајући како гена разликује у различитим типовима ћелија, ткива и болести под условима може помоћи истраживачима разумеју гена функцију и да развију нове лекове и терапије.
Иако је већина ћелија у организму деле исте генетске информације, различите типове ћелија, на пример, коже и ћелија јетре, имају различите особине и функције, углавном зато што су различити гени активни у овим ћелијама. Гена атлас је нову базу података која омогућава корисницима да упит изражавања гена у низ биолошких услова, укључујући и различите типове ћелија, развојне фазе, физиолошка стања, фенотипова и болести државе. Кључна питања ове нове базе података можете да одговорите могу се сажети као:
1. под којим условима је мој посебно гена интересовања?
2. који гени су изражене у одређеном стању? На пример, оно што гени су посебно активне у бубрегу ћелија или како израз гена у леукемиц крви разликују у односу на нормалне крви?
Оба питања може се комбиновати да се фокусирају на одређене гене и њихове улоге у одређене болести, као што су идентификовање чланова ВНТ сигнализација пут да су изражене у рак.
Атлас цоллатес података из преко 1000 различитих независних студија, претежно мицроарраи експерименте, са више од 30.000 узорака у укупно. Нове базе података је најновији производ чипова ЕБИ за информатику групу и има своје порекло у АрраиЕкпресс ресурса ЕБИ је. Након фазе развоја, Атлас је спреман да започне свој живот као независна главни ресурс. Миша Капусхески Атлас вођа пројекта у ЕБИ прокоментарисао: "Док АрраиЕкпресс Архива чини подацима из високе пропусност функционална геномика ассаис доступни стручњацима, гена атлас представља информације у облику доступан на било који биолог. Атлас узима податке директно из АрраиЕкпресс Архива, који је потом обогаћена цуратион, поново коментарима и статистичке прорачуне пре него што су резултати представљени корисника у лако доступним форми. "
Гена атлас је већ нашао примену у индустрији лекова као вредне истраживачке платформе. Ресурса се може приступити из хттп://ввв.еби.ац.ук/гка и чипова информатику групи су производи за е-учење упутство за корисника водич о томе како да бисте добили највише из Атлас. Ово упутство је доступно од ЕБИ е-леарнинг портала на хттп://ввв.еби.ац.ук/траининг/елеарнингцентрал/.